Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDK1Q15118 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDK1Q15118 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDK1Q15118 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDK1Q15118 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDK1Q15118 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDK1Q15118 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDK1Q15118 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDK1Q15118 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDK1Q15118 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDK1Q15118 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDK1Q15118 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDK1Q15118 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDK1Q15118 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDK1Q15118 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
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PDK1Q15118 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDK1Q15118 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDK1Q15118 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDK1Q15118 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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PDK1Q15118 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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PDK1Q15118 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDK1Q15118 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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PDK1Q15118 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDK1Q15118 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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PDK1Q15118 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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PDK1Q15118 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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PDK1Q15118 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDK1Q15118 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDK1Q15118 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
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PDK1Q15118 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDK1Q15118 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDK1Q15118 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
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