Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CDK13Q14004 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CDK13Q14004 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CDK13Q14004 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CDK13Q14004 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CDK13Q14004 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CDK13Q14004 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
CDK13Q14004 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CDK13Q14004 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CDK13Q14004 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CDK13Q14004 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CDK13Q14004 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CDK13Q14004 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
CDK13Q14004 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CDK13Q14004 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CDK13Q14004 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CDK13Q14004 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CDK13Q14004 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
CDK13Q14004 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
CDK13Q14004 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CDK13Q14004 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CDK13Q14004 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CDK13Q14004 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CDK13Q14004 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CDK13Q14004 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CDK13Q14004 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CDK13Q14004 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CDK13Q14004 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CDK13Q14004 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CDK13Q14004 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CDK13Q14004 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CDK13Q14004 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CDK13Q14004 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CDK13Q14004 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CDK13Q14004 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CDK13Q14004 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.39
CDK13Q14004 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CDK13Q14004 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
CDK13Q14004 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CDK13Q14004 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
CDK13Q14004 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CDK13Q14004 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CDK13Q14004 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CDK13Q14004 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CDK13Q14004 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CDK13Q14004 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CDK13Q14004 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
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