Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAPGEF1Q13905 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAPGEF1Q13905 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAPGEF1Q13905 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAPGEF1Q13905 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAPGEF1Q13905 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAPGEF1Q13905 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAPGEF1Q13905 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAPGEF1Q13905 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAPGEF1Q13905 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF1Q13905 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAPGEF1Q13905 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF1Q13905 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAPGEF1Q13905 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF1Q13905 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF1Q13905 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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