Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL1Q13616 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL1Q13616 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL1Q13616 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL1Q13616 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL1Q13616 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL1Q13616 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL1Q13616 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL1Q13616 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUL1Q13616 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUL1Q13616 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL1Q13616 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL1Q13616 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUL1Q13616 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms