Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CUL1Q13616 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CUL1Q13616 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CUL1Q13616 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUL1Q13616 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CUL1Q13616 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUL1Q13616 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CUL1Q13616 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CUL1Q13616 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CUL1Q13616 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUL1Q13616 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUL1Q13616 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CUL1Q13616 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CUL1Q13616 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CUL1Q13616 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CUL1Q13616 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CUL1Q13616 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CUL1Q13616 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CUL1Q13616 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CUL1Q13616 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CUL1Q13616 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CUL1Q13616 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CUL1Q13616 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CUL1Q13616 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CUL1Q13616 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUL1Q13616 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CUL1Q13616 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CUL1Q13616 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CUL1Q13616 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CUL1Q13616 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CUL1Q13616 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CUL1Q13616 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CUL1Q13616 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CUL1Q13616 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CUL1Q13616 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CUL1Q13616 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CUL1Q13616 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CUL1Q13616 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CUL1Q13616 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CUL1Q13616 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CUL1Q13616 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CUL1Q13616 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CUL1Q13616 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CUL1Q13616 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CUL1Q13616 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CUL1Q13616 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CUL1Q13616 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CUL1Q13616 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CUL1Q13616 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CUL1Q13616 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CUL1Q13616 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CUL1Q13616 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CUL1Q13616 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CUL1Q13616 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL1Q13616 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL1Q13616 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CUL1Q13616 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CUL1Q13616 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CUL1Q13616 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL1Q13616 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CUL1Q13616 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CUL1Q13616 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CUL1Q13616 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL1Q13616 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL1Q13616 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CUL1Q13616 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL1Q13616 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL1Q13616 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL1Q13616 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL1Q13616 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL1Q13616 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CUL1Q13616 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CUL1Q13616 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CUL1Q13616 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CUL1Q13616 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CUL1Q13616 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL1Q13616 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CUL1Q13616 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL1Q13616 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CUL1Q13616 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CUL1Q13616 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL1Q13616 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL1Q13616 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL1Q13616 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL1Q13616 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL1Q13616 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CUL1Q13616 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CUL1Q13616 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CUL1Q13616 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CUL1Q13616 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CUL1Q13616 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CUL1Q13616 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CUL1Q13616 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CUL1Q13616 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CUL1Q13616 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL1Q13616 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL1Q13616 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CUL1Q13616 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL1Q13616 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL1Q13616 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
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