Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA4Q13439 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA4Q13439 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA4Q13439 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA4Q13439 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA4Q13439 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA4Q13439 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA4Q13439 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
GOLGA4Q13439 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA4Q13439 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA4Q13439 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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