Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4Q12950 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4Q12950 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4Q12950 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4Q12950 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4Q12950 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4Q12950 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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