Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDD7

C19orf57, Uncharacterized protein C19orf57, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf57Q0VDD7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf57Q0VDD7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf57Q0VDD7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf57Q0VDD7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf57Q0VDD7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C19orf57Q0VDD7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C19orf57Q0VDD7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C19orf57Q0VDD7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C19orf57Q0VDD7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C19orf57Q0VDD7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C19orf57Q0VDD7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms