Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSBP1Q04837 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSBP1Q04837 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSBP1Q04837 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSBP1Q04837 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSBP1Q04837 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSBP1Q04837 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSBP1Q04837 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms