Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPZ1P61923 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPZ1P61923 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPZ1P61923 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPZ1P61923 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPZ1P61923 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPZ1P61923 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COPZ1P61923 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPZ1P61923 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms