Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3BP55884 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF3BP55884 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF3BP55884 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF3BP55884 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF3BP55884 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF3BP55884 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EIF3BP55884 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3BP55884 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF3BP55884 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF3BP55884 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF3BP55884 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF3BP55884 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF3BP55884 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF3BP55884 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF3BP55884 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF3BP55884 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EIF3BP55884 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF3BP55884 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF3BP55884 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF3BP55884 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF3BP55884 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EIF3BP55884 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EIF3BP55884 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms