Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRADP55042 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRADP55042 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRADP55042 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRADP55042 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRADP55042 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRADP55042 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRADP55042 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRADP55042 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRADP55042 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRADP55042 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRADP55042 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRADP55042 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRADP55042 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRADP55042 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRADP55042 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRADP55042 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRADP55042 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRADP55042 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRADP55042 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRADP55042 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRADP55042 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRADP55042 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRADP55042 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRADP55042 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRADP55042 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRADP55042 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRADP55042 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRADP55042 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRADP55042 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRADP55042 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRADP55042 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRADP55042 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRADP55042 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRADP55042 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRADP55042 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRADP55042 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRADP55042 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRADP55042 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRADP55042 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRADP55042 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRADP55042 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRADP55042 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRADP55042 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRADP55042 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRADP55042 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRADP55042 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRADP55042 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRADP55042 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRADP55042 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRADP55042 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRADP55042 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRADP55042 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRADP55042 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRADP55042 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRADP55042 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRADP55042 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRADP55042 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRADP55042 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRADP55042 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRADP55042 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRADP55042 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRADP55042 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRADP55042 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRADP55042 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRADP55042 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRADP55042 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRADP55042 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRADP55042 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRADP55042 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRADP55042 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRADP55042 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRADP55042 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRADP55042 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRADP55042 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRADP55042 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRADP55042 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRADP55042 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRADP55042 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRADP55042 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRADP55042 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRADP55042 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRADP55042 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRADP55042 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRADP55042 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRADP55042 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRADP55042 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRADP55042 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRADP55042 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRADP55042 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRADP55042 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRADP55042 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRADP55042 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms