Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMS2P54278 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMS2P54278 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMS2P54278 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS2P54278 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS2P54278 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS2P54278 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PMS2P54278 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS2P54278 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS2P54278 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS2P54278 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMS2P54278 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMS2P54278 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMS2P54278 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMS2P54278 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS2P54278 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS2P54278 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMS2P54278 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMS2P54278 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS2P54278 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS2P54278 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMS2P54278 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMS2P54278 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMS2P54278 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMS2P54278 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS2P54278 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PMS2P54278 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PMS2P54278 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PMS2P54278 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PMS2P54278 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PMS2P54278 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PMS2P54278 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PMS2P54278 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PMS2P54278 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PMS2P54278 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PMS2P54278 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PMS2P54278 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PMS2P54278 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PMS2P54278 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PMS2P54278 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PMS2P54278 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PMS2P54278 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PMS2P54278 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PMS2P54278 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PMS2P54278 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PMS2P54278 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PMS2P54278 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PMS2P54278 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PMS2P54278 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PMS2P54278 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PMS2P54278 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PMS2P54278 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PMS2P54278 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PMS2P54278 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PMS2P54278 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PMS2P54278 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PMS2P54278 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PMS2P54278 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PMS2P54278 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PMS2P54278 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PMS2P54278 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PMS2P54278 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PMS2P54278 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PMS2P54278 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PMS2P54278 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PMS2P54278 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PMS2P54278 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PMS2P54278 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PMS2P54278 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PMS2P54278 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PMS2P54278 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PMS2P54278 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PMS2P54278 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PMS2P54278 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PMS2P54278 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PMS2P54278 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PMS2P54278 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PMS2P54278 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PMS2P54278 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PMS2P54278 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PMS2P54278 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PMS2P54278 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PMS2P54278 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PMS2P54278 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PMS2P54278 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PMS2P54278 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PMS2P54278 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PMS2P54278 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PMS2P54278 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PMS2P54278 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PMS2P54278 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PMS2P54278 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PMS2P54278 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PMS2P54278 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PMS2P54278 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PMS2P54278 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PMS2P54278 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PMS2P54278 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PMS2P54278 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PMS2P54278 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.3 ms