Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1A2P50993 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP1A2P50993 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A2P50993 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A2P50993 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP1A2P50993 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A2P50993 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A2P50993 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A2P50993 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A2P50993 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A2P50993 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP1A2P50993 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP1A2P50993 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP1A2P50993 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP1A2P50993 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP1A2P50993 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP1A2P50993 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP1A2P50993 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP1A2P50993 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP1A2P50993 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP1A2P50993 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP1A2P50993 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP1A2P50993 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms