Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NDUFV1P49821 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NDUFV1P49821 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NDUFV1P49821 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NDUFV1P49821 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NDUFV1P49821 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NDUFV1P49821 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NDUFV1P49821 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NDUFV1P49821 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NDUFV1P49821 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NDUFV1P49821 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NDUFV1P49821 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NDUFV1P49821 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NDUFV1P49821 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NDUFV1P49821 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NDUFV1P49821 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms