Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SLC4A3P48751 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC4A3P48751 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC4A3P48751 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC4A3P48751 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC4A3P48751 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC4A3P48751 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLC4A3P48751 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC4A3P48751 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLC4A3P48751 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLC4A3P48751 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLC4A3P48751 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC4A3P48751 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC4A3P48751 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC4A3P48751 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC4A3P48751 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC4A3P48751 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SLC4A3P48751 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC4A3P48751 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC4A3P48751 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC4A3P48751 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC4A3P48751 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC4A3P48751 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC4A3P48751 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A3P48751 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLC4A3P48751 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC4A3P48751 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A3P48751 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC4A3P48751 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms