Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITPNBP48739 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNBP48739 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNBP48739 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNBP48739 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNBP48739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNBP48739 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNBP48739 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNBP48739 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms