Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-1P43699 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-1P43699 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-1P43699 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-1P43699 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-1P43699 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-1P43699 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-1P43699 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-1P43699 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-1P43699 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-1P43699 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-1P43699 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms