Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL5P42830 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL5P42830 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL5P42830 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL5P42830 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL5P42830 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms