Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THBS4P35443 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
THBS4P35443 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THBS4P35443 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THBS4P35443 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THBS4P35443 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THBS4P35443 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THBS4P35443 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THBS4P35443 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
THBS4P35443 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THBS4P35443 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THBS4P35443 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THBS4P35443 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
THBS4P35443 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THBS4P35443 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THBS4P35443 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THBS4P35443 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THBS4P35443 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THBS4P35443 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THBS4P35443 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THBS4P35443 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THBS4P35443 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THBS4P35443 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THBS4P35443 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THBS4P35443 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THBS4P35443 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THBS4P35443 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THBS4P35443 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THBS4P35443 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THBS4P35443 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THBS4P35443 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THBS4P35443 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THBS4P35443 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THBS4P35443 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THBS4P35443 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THBS4P35443 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THBS4P35443 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THBS4P35443 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THBS4P35443 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THBS4P35443 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THBS4P35443 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THBS4P35443 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS4P35443 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS4P35443 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS4P35443 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS4P35443 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS4P35443 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS4P35443 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS4P35443 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS4P35443 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS4P35443 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS4P35443 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THBS4P35443 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS4P35443 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS4P35443 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS4P35443 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS4P35443 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THBS4P35443 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THBS4P35443 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THBS4P35443 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS4P35443 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS4P35443 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS4P35443 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS4P35443 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS4P35443 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS4P35443 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS4P35443 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS4P35443 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS4P35443 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS4P35443 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS4P35443 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS4P35443 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS4P35443 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS4P35443 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS4P35443 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THBS4P35443 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THBS4P35443 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THBS4P35443 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS4P35443 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS4P35443 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS4P35443 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS4P35443 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS4P35443 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS4P35443 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS4P35443 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS4P35443 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS4P35443 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THBS4P35443 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THBS4P35443 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THBS4P35443 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THBS4P35443 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS4P35443 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS4P35443 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS4P35443 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS4P35443 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS4P35443 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS4P35443 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS4P35443 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS4P35443 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS4P35443 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms