Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP2P32456 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GBP2P32456 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GBP2P32456 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GBP2P32456 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP2P32456 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP2P32456 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP2P32456 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP2P32456 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP2P32456 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GBP2P32456 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP2P32456 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GBP2P32456 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP2P32456 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GBP2P32456 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GBP2P32456 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GBP2P32456 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GBP2P32456 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GBP2P32456 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GBP2P32456 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GBP2P32456 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP2P32456 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP2P32456 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP2P32456 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GBP2P32456 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GBP2P32456 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GBP2P32456 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GBP2P32456 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GBP2P32456 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GBP2P32456 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP2P32456 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP2P32456 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP2P32456 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP2P32456 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GBP2P32456 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GBP2P32456 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GBP2P32456 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GBP2P32456 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GBP2P32456 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GBP2P32456 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GBP2P32456 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GBP2P32456 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GBP2P32456 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GBP2P32456 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GBP2P32456 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GBP2P32456 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP2P32456 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GBP2P32456 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GBP2P32456 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP2P32456 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GBP2P32456 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GBP2P32456 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GBP2P32456 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GBP2P32456 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GBP2P32456 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP2P32456 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP2P32456 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP2P32456 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GBP2P32456 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GBP2P32456 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GBP2P32456 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GBP2P32456 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP2P32456 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP2P32456 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GBP2P32456 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GBP2P32456 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP2P32456 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP2P32456 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP2P32456 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP2P32456 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP2P32456 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP2P32456 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP2P32456 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP2P32456 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP2P32456 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP2P32456 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GBP2P32456 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GBP2P32456 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP2P32456 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP2P32456 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP2P32456 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP2P32456 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP2P32456 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP2P32456 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP2P32456 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP2P32456 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GBP2P32456 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP2P32456 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP2P32456 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP2P32456 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP2P32456 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP2P32456 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GBP2P32456 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GBP2P32456 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP2P32456 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP2P32456 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP2P32456 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP2P32456 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP2P32456 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP2P32456 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms