Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXA7P31268 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXA7P31268 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HOXA7P31268 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HOXA7P31268 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HOXA7P31268 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HOXA7P31268 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXA7P31268 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HOXA7P31268 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
HOXA7P31268 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXA7P31268 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXA7P31268 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA7P31268 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXA7P31268 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HOXA7P31268 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HOXA7P31268 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms