Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E2P29084 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E2P29084 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E2P29084 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E2P29084 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E2P29084 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E2P29084 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E2P29084 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E2P29084 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E2P29084 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E2P29084 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E2P29084 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E2P29084 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E2P29084 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms