Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MGAT1P26572 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MGAT1P26572 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MGAT1P26572 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MGAT1P26572 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGAT1P26572 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGAT1P26572 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGAT1P26572 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MGAT1P26572 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MGAT1P26572 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT1P26572 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MGAT1P26572 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MGAT1P26572 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms