Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP24386 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP24386 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP24386 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP24386 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP24386 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP24386 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP24386 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP24386 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP24386 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP24386 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP24386 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP24386 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP24386 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP24386 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP24386 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP24386 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP24386 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP24386 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP24386 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP24386 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP24386 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP24386 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP24386 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP24386 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP24386 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP24386 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP24386 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP24386 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP24386 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP24386 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP24386 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP24386 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP24386 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP24386 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP24386 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP24386 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP24386 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP24386 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP24386 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP24386 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP24386 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP24386 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP24386 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP24386 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP24386 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP24386 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP24386 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP24386 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP24386 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP24386 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP24386 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP24386 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP24386 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP24386 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP24386 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHMP24386 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP24386 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP24386 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP24386 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP24386 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP24386 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP24386 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP24386 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP24386 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP24386 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP24386 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP24386 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP24386 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP24386 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP24386 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP24386 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP24386 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP24386 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP24386 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP24386 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP24386 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP24386 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP24386 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP24386 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP24386 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP24386 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP24386 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP24386 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP24386 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP24386 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP24386 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP24386 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP24386 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP24386 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP24386 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP24386 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP24386 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP24386 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP24386 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP24386 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP24386 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP24386 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP24386 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP24386 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms