Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMP24386 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP24386 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP24386 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP24386 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMP24386 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMP24386 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CHMP24386 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CHMP24386 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMP24386 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP24386 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP24386 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP24386 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP24386 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP24386 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP24386 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP24386 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP24386 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP24386 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP24386 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP24386 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP24386 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP24386 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP24386 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP24386 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP24386 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP24386 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP24386 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP24386 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP24386 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP24386 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP24386 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP24386 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP24386 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP24386 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP24386 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP24386 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP24386 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP24386 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP24386 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP24386 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP24386 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP24386 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP24386 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP24386 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP24386 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP24386 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP24386 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP24386 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP24386 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP24386 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP24386 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP24386 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP24386 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP24386 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP24386 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP24386 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP24386 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP24386 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP24386 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP24386 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP24386 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP24386 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP24386 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP24386 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP24386 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP24386 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP24386 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP24386 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP24386 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP24386 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP24386 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP24386 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP24386 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP24386 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP24386 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP24386 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP24386 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP24386 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP24386 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP24386 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP24386 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP24386 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP24386 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP24386 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP24386 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP24386 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP24386 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP24386 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP24386 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP24386 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP24386 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP24386 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP24386 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP24386 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP24386 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP24386 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP24386 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP24386 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP24386 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms