Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MATN1P21941 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN1P21941 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN1P21941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN1P21941 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN1P21941 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN1P21941 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MATN1P21941 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN1P21941 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN1P21941 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN1P21941 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN1P21941 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN1P21941 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN1P21941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MATN1P21941 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN1P21941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MATN1P21941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN1P21941 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN1P21941 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN1P21941 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN1P21941 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN1P21941 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN1P21941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN1P21941 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN1P21941 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN1P21941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN1P21941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN1P21941 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MATN1P21941 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN1P21941 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN1P21941 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MATN1P21941 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MATN1P21941 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MATN1P21941 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN1P21941 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN1P21941 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN1P21941 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MATN1P21941 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MATN1P21941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN1P21941 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN1P21941 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN1P21941 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN1P21941 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MATN1P21941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN1P21941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN1P21941 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN1P21941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN1P21941 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN1P21941 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN1P21941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MATN1P21941 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MATN1P21941 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN1P21941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN1P21941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN1P21941 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN1P21941 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MATN1P21941 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN1P21941 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN1P21941 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN1P21941 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN1P21941 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN1P21941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN1P21941 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN1P21941 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN1P21941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN1P21941 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN1P21941 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN1P21941 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN1P21941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN1P21941 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN1P21941 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN1P21941 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN1P21941 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN1P21941 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN1P21941 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN1P21941 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN1P21941 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN1P21941 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN1P21941 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN1P21941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN1P21941 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN1P21941 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN1P21941 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN1P21941 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN1P21941 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN1P21941 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN1P21941 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN1P21941 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MATN1P21941 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN1P21941 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN1P21941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN1P21941 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MATN1P21941 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN1P21941 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN1P21941 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN1P21941 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN1P21941 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN1P21941 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN1P21941 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN1P21941 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms