Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCN1P20061 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCN1P20061 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCN1P20061 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCN1P20061 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCN1P20061 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCN1P20061 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCN1P20061 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCN1P20061 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCN1P20061 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCN1P20061 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCN1P20061 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCN1P20061 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCN1P20061 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCN1P20061 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCN1P20061 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCN1P20061 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCN1P20061 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCN1P20061 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCN1P20061 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCN1P20061 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCN1P20061 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCN1P20061 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCN1P20061 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCN1P20061 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCN1P20061 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCN1P20061 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCN1P20061 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCN1P20061 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCN1P20061 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCN1P20061 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCN1P20061 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCN1P20061 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCN1P20061 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCN1P20061 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCN1P20061 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCN1P20061 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCN1P20061 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCN1P20061 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCN1P20061 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCN1P20061 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCN1P20061 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCN1P20061 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCN1P20061 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCN1P20061 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCN1P20061 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCN1P20061 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCN1P20061 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCN1P20061 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCN1P20061 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCN1P20061 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCN1P20061 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCN1P20061 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCN1P20061 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCN1P20061 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCN1P20061 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCN1P20061 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TCN1P20061 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCN1P20061 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCN1P20061 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCN1P20061 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCN1P20061 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCN1P20061 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCN1P20061 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCN1P20061 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN1P20061 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN1P20061 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN1P20061 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN1P20061 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN1P20061 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN1P20061 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCN1P20061 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCN1P20061 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCN1P20061 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCN1P20061 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCN1P20061 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCN1P20061 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCN1P20061 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCN1P20061 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCN1P20061 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCN1P20061 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCN1P20061 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCN1P20061 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCN1P20061 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCN1P20061 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCN1P20061 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCN1P20061 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCN1P20061 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCN1P20061 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCN1P20061 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN1P20061 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN1P20061 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN1P20061 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN1P20061 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCN1P20061 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCN1P20061 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCN1P20061 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCN1P20061 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCN1P20061 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCN1P20061 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms