Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM225BP0DP42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM225BP0DP42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM225BP0DP42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM225BP0DP42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225BP0DP42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225BP0DP42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM225BP0DP42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms