Protein–RNA interactions for Protein: P0CV99

TSPY4, Testis-specific Y-encoded protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPY4P0CV99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TSPY4P0CV99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TSPY4P0CV99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TSPY4P0CV99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TSPY4P0CV99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
TSPY4P0CV99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
TSPY4P0CV99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
TSPY4P0CV99 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TSPY4P0CV99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TSPY4P0CV99 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TSPY4P0CV99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
TSPY4P0CV99 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TSPY4P0CV99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TSPY4P0CV99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TSPY4P0CV99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TSPY4P0CV99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TSPY4P0CV99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TSPY4P0CV99 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
TSPY4P0CV99 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TSPY4P0CV99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
TSPY4P0CV99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TSPY4P0CV99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TSPY4P0CV99 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TSPY4P0CV99 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TSPY4P0CV99 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TSPY4P0CV99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms