Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRR35P0CG20 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRR35P0CG20 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR35P0CG20 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR35P0CG20 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRR35P0CG20 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRR35P0CG20 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR35P0CG20 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR35P0CG20 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRR35P0CG20 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRR35P0CG20 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRR35P0CG20 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR35P0CG20 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR35P0CG20 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRR35P0CG20 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR35P0CG20 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms