Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPLP1P05386 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPLP1P05386 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPLP1P05386 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPLP1P05386 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPLP1P05386 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPLP1P05386 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPLP1P05386 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPLP1P05386 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPLP1P05386 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPLP1P05386 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPLP1P05386 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPLP1P05386 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPLP1P05386 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPLP1P05386 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPLP1P05386 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPLP1P05386 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPLP1P05386 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPLP1P05386 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPLP1P05386 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms