Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPLP1P05386 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPLP1P05386 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPLP1P05386 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPLP1P05386 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPLP1P05386 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPLP1P05386 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPLP1P05386 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPLP1P05386 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPLP1P05386 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPLP1P05386 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPLP1P05386 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP1P05386 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP1P05386 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPLP1P05386 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPLP1P05386 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPLP1P05386 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPLP1P05386 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPLP1P05386 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPLP1P05386 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPLP1P05386 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPLP1P05386 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPLP1P05386 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPLP1P05386 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPLP1P05386 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPLP1P05386 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPLP1P05386 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPLP1P05386 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPLP1P05386 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPLP1P05386 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPLP1P05386 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPLP1P05386 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPLP1P05386 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPLP1P05386 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPLP1P05386 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPLP1P05386 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPLP1P05386 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPLP1P05386 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPLP1P05386 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPLP1P05386 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPLP1P05386 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPLP1P05386 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPLP1P05386 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPLP1P05386 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPLP1P05386 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPLP1P05386 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPLP1P05386 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPLP1P05386 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPLP1P05386 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPLP1P05386 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPLP1P05386 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPLP1P05386 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPLP1P05386 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPLP1P05386 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPLP1P05386 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPLP1P05386 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPLP1P05386 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPLP1P05386 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPLP1P05386 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPLP1P05386 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPLP1P05386 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPLP1P05386 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPLP1P05386 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPLP1P05386 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPLP1P05386 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPLP1P05386 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPLP1P05386 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPLP1P05386 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPLP1P05386 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPLP1P05386 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPLP1P05386 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPLP1P05386 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPLP1P05386 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPLP1P05386 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPLP1P05386 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPLP1P05386 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPLP1P05386 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPLP1P05386 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPLP1P05386 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPLP1P05386 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPLP1P05386 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPLP1P05386 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPLP1P05386 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPLP1P05386 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPLP1P05386 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPLP1P05386 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPLP1P05386 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPLP1P05386 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPLP1P05386 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPLP1P05386 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPLP1P05386 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPLP1P05386 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPLP1P05386 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPLP1P05386 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPLP1P05386 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPLP1P05386 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPLP1P05386 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPLP1P05386 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms