Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALX3O95076 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALX3O95076 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX3O95076 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX3O95076 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX3O95076 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX3O95076 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX3O95076 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX3O95076 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX3O95076 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX3O95076 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX3O95076 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX3O95076 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX3O95076 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX3O95076 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX3O95076 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX3O95076 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX3O95076 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX3O95076 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX3O95076 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX3O95076 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX3O95076 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX3O95076 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX3O95076 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX3O95076 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX3O95076 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX3O95076 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX3O95076 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX3O95076 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX3O95076 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX3O95076 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX3O95076 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX3O95076 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX3O95076 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX3O95076 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX3O95076 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX3O95076 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX3O95076 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX3O95076 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX3O95076 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX3O95076 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX3O95076 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX3O95076 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX3O95076 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX3O95076 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX3O95076 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX3O95076 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX3O95076 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX3O95076 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX3O95076 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX3O95076 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX3O95076 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX3O95076 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX3O95076 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX3O95076 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX3O95076 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX3O95076 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX3O95076 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX3O95076 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX3O95076 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX3O95076 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX3O95076 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX3O95076 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX3O95076 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX3O95076 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX3O95076 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX3O95076 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX3O95076 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX3O95076 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX3O95076 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX3O95076 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX3O95076 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX3O95076 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX3O95076 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX3O95076 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX3O95076 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX3O95076 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX3O95076 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX3O95076 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX3O95076 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX3O95076 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX3O95076 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX3O95076 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX3O95076 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX3O95076 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX3O95076 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX3O95076 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX3O95076 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX3O95076 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX3O95076 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX3O95076 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX3O95076 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX3O95076 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX3O95076 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX3O95076 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX3O95076 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX3O95076 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALX3O95076 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX3O95076 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX3O95076 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms