Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UPP2O95045 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPP2O95045 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
UPP2O95045 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPP2O95045 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPP2O95045 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPP2O95045 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPP2O95045 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPP2O95045 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPP2O95045 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UPP2O95045 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UPP2O95045 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPP2O95045 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPP2O95045 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UPP2O95045 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
UPP2O95045 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPP2O95045 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPP2O95045 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPP2O95045 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPP2O95045 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPP2O95045 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UPP2O95045 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UPP2O95045 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UPP2O95045 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UPP2O95045 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UPP2O95045 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UPP2O95045 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UPP2O95045 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UPP2O95045 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UPP2O95045 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UPP2O95045 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UPP2O95045 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPP2O95045 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPP2O95045 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPP2O95045 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UPP2O95045 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UPP2O95045 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UPP2O95045 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UPP2O95045 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPP2O95045 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPP2O95045 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPP2O95045 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UPP2O95045 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UPP2O95045 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPP2O95045 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPP2O95045 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPP2O95045 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPP2O95045 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UPP2O95045 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UPP2O95045 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UPP2O95045 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UPP2O95045 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UPP2O95045 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UPP2O95045 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
UPP2O95045 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UPP2O95045 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UPP2O95045 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UPP2O95045 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UPP2O95045 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UPP2O95045 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UPP2O95045 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UPP2O95045 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UPP2O95045 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UPP2O95045 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPP2O95045 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UPP2O95045 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UPP2O95045 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UPP2O95045 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPP2O95045 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPP2O95045 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPP2O95045 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UPP2O95045 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UPP2O95045 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UPP2O95045 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPP2O95045 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPP2O95045 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPP2O95045 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPP2O95045 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPP2O95045 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPP2O95045 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
UPP2O95045 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPP2O95045 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPP2O95045 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPP2O95045 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UPP2O95045 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UPP2O95045 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPP2O95045 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPP2O95045 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPP2O95045 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPP2O95045 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPP2O95045 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPP2O95045 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPP2O95045 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPP2O95045 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPP2O95045 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
UPP2O95045 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPP2O95045 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UPP2O95045 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
UPP2O95045 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPP2O95045 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms