Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ9O75208 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ9O75208 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ9O75208 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ9O75208 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ9O75208 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ9O75208 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ9O75208 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ9O75208 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ9O75208 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ9O75208 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ9O75208 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ9O75208 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ9O75208 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ9O75208 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COQ9O75208 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COQ9O75208 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COQ9O75208 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COQ9O75208 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COQ9O75208 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ9O75208 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ9O75208 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ9O75208 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ9O75208 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ9O75208 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ9O75208 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COQ9O75208 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ9O75208 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ9O75208 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COQ9O75208 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COQ9O75208 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COQ9O75208 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ9O75208 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ9O75208 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ9O75208 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ9O75208 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ9O75208 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COQ9O75208 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COQ9O75208 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ9O75208 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ9O75208 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ9O75208 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ9O75208 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ9O75208 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ9O75208 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ9O75208 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ9O75208 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ9O75208 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ9O75208 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ9O75208 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ9O75208 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ9O75208 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ9O75208 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ9O75208 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COQ9O75208 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ9O75208 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ9O75208 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ9O75208 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ9O75208 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ9O75208 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ9O75208 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ9O75208 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ9O75208 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ9O75208 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ9O75208 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ9O75208 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COQ9O75208 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ9O75208 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ9O75208 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ9O75208 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ9O75208 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COQ9O75208 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COQ9O75208 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COQ9O75208 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COQ9O75208 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ9O75208 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ9O75208 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ9O75208 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ9O75208 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ9O75208 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ9O75208 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ9O75208 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COQ9O75208 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COQ9O75208 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COQ9O75208 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COQ9O75208 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ9O75208 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ9O75208 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ9O75208 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ9O75208 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ9O75208 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ9O75208 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ9O75208 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ9O75208 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ9O75208 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ9O75208 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ9O75208 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ9O75208 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ9O75208 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ9O75208 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms