Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VILLO15195 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VILLO15195 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VILLO15195 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VILLO15195 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VILLO15195 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VILLO15195 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VILLO15195 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VILLO15195 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VILLO15195 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VILLO15195 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VILLO15195 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VILLO15195 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VILLO15195 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VILLO15195 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VILLO15195 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VILLO15195 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VILLO15195 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VILLO15195 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VILLO15195 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VILLO15195 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VILLO15195 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VILLO15195 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VILLO15195 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VILLO15195 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VILLO15195 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VILLO15195 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VILLO15195 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VILLO15195 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VILLO15195 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VILLO15195 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VILLO15195 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VILLO15195 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VILLO15195 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VILLO15195 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VILLO15195 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VILLO15195 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VILLO15195 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VILLO15195 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VILLO15195 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VILLO15195 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VILLO15195 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VILLO15195 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VILLO15195 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VILLO15195 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VILLO15195 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VILLO15195 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VILLO15195 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VILLO15195 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VILLO15195 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VILLO15195 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
VILLO15195 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VILLO15195 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VILLO15195 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VILLO15195 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VILLO15195 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VILLO15195 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VILLO15195 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VILLO15195 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VILLO15195 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VILLO15195 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VILLO15195 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VILLO15195 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VILLO15195 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VILLO15195 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VILLO15195 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VILLO15195 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VILLO15195 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VILLO15195 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VILLO15195 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VILLO15195 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VILLO15195 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VILLO15195 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VILLO15195 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VILLO15195 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VILLO15195 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VILLO15195 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VILLO15195 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VILLO15195 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VILLO15195 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VILLO15195 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VILLO15195 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VILLO15195 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VILLO15195 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VILLO15195 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VILLO15195 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VILLO15195 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VILLO15195 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VILLO15195 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VILLO15195 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VILLO15195 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VILLO15195 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VILLO15195 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VILLO15195 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VILLO15195 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VILLO15195 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VILLO15195 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VILLO15195 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VILLO15195 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VILLO15195 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms