Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
VILLO15195 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VILLO15195 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VILLO15195 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VILLO15195 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VILLO15195 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VILLO15195 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
VILLO15195 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
VILLO15195 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VILLO15195 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
VILLO15195 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VILLO15195 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VILLO15195 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
VILLO15195 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
VILLO15195 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
VILLO15195 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VILLO15195 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
VILLO15195 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
VILLO15195 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
VILLO15195 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
VILLO15195 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VILLO15195 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
VILLO15195 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VILLO15195 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
VILLO15195 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
VILLO15195 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VILLO15195 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VILLO15195 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
VILLO15195 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
VILLO15195 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VILLO15195 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VILLO15195 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VILLO15195 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
VILLO15195 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
VILLO15195 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VILLO15195 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VILLO15195 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VILLO15195 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
VILLO15195 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
VILLO15195 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VILLO15195 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
VILLO15195 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
VILLO15195 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VILLO15195 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VILLO15195 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VILLO15195 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VILLO15195 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VILLO15195 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VILLO15195 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VILLO15195 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VILLO15195 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VILLO15195 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VILLO15195 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VILLO15195 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VILLO15195 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VILLO15195 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VILLO15195 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VILLO15195 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VILLO15195 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
VILLO15195 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VILLO15195 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VILLO15195 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VILLO15195 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VILLO15195 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VILLO15195 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VILLO15195 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
VILLO15195 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VILLO15195 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VILLO15195 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VILLO15195 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VILLO15195 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VILLO15195 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VILLO15195 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VILLO15195 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VILLO15195 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VILLO15195 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VILLO15195 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VILLO15195 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VILLO15195 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VILLO15195 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VILLO15195 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VILLO15195 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VILLO15195 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VILLO15195 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VILLO15195 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VILLO15195 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VILLO15195 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VILLO15195 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VILLO15195 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VILLO15195 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VILLO15195 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VILLO15195 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VILLO15195 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VILLO15195 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VILLO15195 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VILLO15195 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VILLO15195 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VILLO15195 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VILLO15195 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VILLO15195 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms