Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA4O00629 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KPNA4O00629 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA4O00629 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA4O00629 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA4O00629 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KPNA4O00629 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA4O00629 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA4O00629 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms