Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARNTLO00327 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARNTLO00327 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARNTLO00327 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARNTLO00327 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARNTLO00327 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARNTLO00327 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARNTLO00327 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARNTLO00327 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARNTLO00327 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARNTLO00327 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms