Protein–RNA interactions for Protein: H0Y858

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0Y858 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
H0Y858 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H0Y858 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H0Y858 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H0Y858 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H0Y858 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
H0Y858 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
H0Y858 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H0Y858 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
H0Y858 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H0Y858 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H0Y858 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H0Y858 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H0Y858 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H0Y858 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H0Y858 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
H0Y858 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
H0Y858 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H0Y858 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H0Y858 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
H0Y858 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
H0Y858 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
H0Y858 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H0Y858 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H0Y858 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H0Y858 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H0Y858 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H0Y858 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H0Y858 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
H0Y858 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H0Y858 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H0Y858 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H0Y858 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H0Y858 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H0Y858 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H0Y858 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H0Y858 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H0Y858 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H0Y858 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
H0Y858 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H0Y858 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H0Y858 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H0Y858 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H0Y858 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H0Y858 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H0Y858 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H0Y858 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H0Y858 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H0Y858 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H0Y858 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H0Y858 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H0Y858 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
H0Y858 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H0Y858 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H0Y858 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H0Y858 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H0Y858 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H0Y858 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H0Y858 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
H0Y858 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H0Y858 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H0Y858 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H0Y858 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
H0Y858 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
H0Y858 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H0Y858 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H0Y858 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
H0Y858 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
H0Y858 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H0Y858 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H0Y858 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H0Y858 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H0Y858 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
H0Y858 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H0Y858 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H0Y858 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H0Y858 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H0Y858 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H0Y858 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H0Y858 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H0Y858 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H0Y858 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H0Y858 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H0Y858 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H0Y858 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H0Y858 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H0Y858 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H0Y858 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H0Y858 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H0Y858 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H0Y858 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H0Y858 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H0Y858 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H0Y858 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
H0Y858 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0Y858 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0Y858 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0Y858 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0Y858 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
H0Y858 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms