Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B8ZZF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B8ZZF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B8ZZF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B8ZZF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B8ZZF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B8ZZF3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B8ZZF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B8ZZF3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
B8ZZF3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B8ZZF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B8ZZF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B8ZZF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B8ZZF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B8ZZF3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B8ZZF3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B8ZZF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B8ZZF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B8ZZF3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B8ZZF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B8ZZF3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B8ZZF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B8ZZF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B8ZZF3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B8ZZF3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B8ZZF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
B8ZZF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B8ZZF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B8ZZF3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
B8ZZF3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B8ZZF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B8ZZF3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B8ZZF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B8ZZF3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B8ZZF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B8ZZF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B8ZZF3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B8ZZF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B8ZZF3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B8ZZF3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B8ZZF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B8ZZF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B8ZZF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B8ZZF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B8ZZF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B8ZZF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B8ZZF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
B8ZZF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
B8ZZF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
B8ZZF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B8ZZF3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B8ZZF3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B8ZZF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B8ZZF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B8ZZF3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B8ZZF3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
B8ZZF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B8ZZF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B8ZZF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B8ZZF3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B8ZZF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B8ZZF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B8ZZF3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B8ZZF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
B8ZZF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B8ZZF3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B8ZZF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B8ZZF3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B8ZZF3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B8ZZF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B8ZZF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B8ZZF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B8ZZF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B8ZZF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B8ZZF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B8ZZF3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B8ZZF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B8ZZF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B8ZZF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B8ZZF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B8ZZF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B8ZZF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B8ZZF3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B8ZZF3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B8ZZF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B8ZZF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
B8ZZF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
B8ZZF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B8ZZF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B8ZZF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B8ZZF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B8ZZF3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B8ZZF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B8ZZF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B8ZZF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B8ZZF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
B8ZZF3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
B8ZZF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B8ZZF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B8ZZF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms