Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO5BA8MYB1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMCO5BA8MYB1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMCO5BA8MYB1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMCO5BA8MYB1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMCO5BA8MYB1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMCO5BA8MYB1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMCO5BA8MYB1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMCO5BA8MYB1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMCO5BA8MYB1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMCO5BA8MYB1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMCO5BA8MYB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMCO5BA8MYB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMCO5BA8MYB1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMCO5BA8MYB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMCO5BA8MYB1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMCO5BA8MYB1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO5BA8MYB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO5BA8MYB1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO5BA8MYB1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMCO5BA8MYB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms