Protein–RNA interactions for Protein: A8MXY4

ZNF99, Zinc finger protein 99, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF99A8MXY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF99A8MXY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF99A8MXY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF99A8MXY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF99A8MXY4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF99A8MXY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF99A8MXY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF99A8MXY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms