Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH2D7A6NKC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH2D7A6NKC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D7A6NKC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH2D7A6NKC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH2D7A6NKC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH2D7A6NKC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms