Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP5A6NIR3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP5A6NIR3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP5A6NIR3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP5A6NIR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP5A6NIR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP5A6NIR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP5A6NIR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP5A6NIR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP5A6NIR3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP5A6NIR3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP5A6NIR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP5A6NIR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP5A6NIR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP5A6NIR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.3 ms