Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA6L9A6NEM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA6L9A6NEM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA6L9A6NEM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L9A6NEM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L9A6NEM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA6L9A6NEM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms