Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO3Q9Y5L0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNPO3Q9Y5L0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNPO3Q9Y5L0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNPO3Q9Y5L0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO3Q9Y5L0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO3Q9Y5L0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO3Q9Y5L0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO3Q9Y5L0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO3Q9Y5L0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO3Q9Y5L0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO3Q9Y5L0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNPO3Q9Y5L0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO3Q9Y5L0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO3Q9Y5L0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO3Q9Y5L0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO3Q9Y5L0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO3Q9Y5L0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms