Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
R3HCC1Q9Y3T6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
R3HCC1Q9Y3T6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
R3HCC1Q9Y3T6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
R3HCC1Q9Y3T6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
R3HCC1Q9Y3T6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
R3HCC1Q9Y3T6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
R3HCC1Q9Y3T6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
R3HCC1Q9Y3T6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
R3HCC1Q9Y3T6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
R3HCC1Q9Y3T6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
R3HCC1Q9Y3T6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
R3HCC1Q9Y3T6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms