Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCE1Q9Y256 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCE1Q9Y256 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCE1Q9Y256 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCE1Q9Y256 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCE1Q9Y256 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCE1Q9Y256 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCE1Q9Y256 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCE1Q9Y256 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCE1Q9Y256 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCE1Q9Y256 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCE1Q9Y256 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCE1Q9Y256 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCE1Q9Y256 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCE1Q9Y256 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCE1Q9Y256 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCE1Q9Y256 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCE1Q9Y256 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCE1Q9Y256 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCE1Q9Y256 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCE1Q9Y256 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCE1Q9Y256 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCE1Q9Y256 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCE1Q9Y256 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCE1Q9Y256 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCE1Q9Y256 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCE1Q9Y256 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCE1Q9Y256 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCE1Q9Y256 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238 ms